Gwasanaethau NGS

Mae labordy Cyfleuster Genomeg Parc Geneteg Cymru, sydd yng Nghanolfan Iechyd Genomig Cymru, yn defnyddio offer NGS ym Mhrifysgol Caerdydd a Gwasanaeth Genomeg Cymru Gyfan y GIG (AWMGS). Mae gan staff y labordy gwlyb ddegawdau o brofiad ar ôl profi newid o ddilyniannu cenhedlaeth “gyntaf” i’r genhedlaeth “nesaf”, a’i weithredu gyda’i gymwysiadau ym maes geneteg ddynol a chanser.

Defnyddir dilyniant DNA a RNA trwybwn uchel (cenhedlaeth nesaf) yn gyson mewn ymchwil ym maes geneteg a biofeddygaeth fodern, ar gyfer ystod o gymwysiadau. Mae Parc Geneteg Cymru yn cynnig dull hyblyg, pwrpasol o helpu ymchwilwyr i gyrchu technoleg dilyniannu trwybwn uchel ar gyfer ymchwil fiofeddygol yng Nghymru.  Rydym yn gweithio gyda chydweithwyr academaidd ac eraill ac yn cynnig cyngor a chymorth arbenigol sy’n diwallu anghenion prosiectau ymchwil, o ddylunio prosiectau i ddadansoddiadau trydyddol. Rydym yn gweithio i sicrhau bod modd cael gafael ar y technolegau hyn am gost resymol er mwyn annog pobl i ddefnyddio’r dechnoleg hollbwysig hon.

Ansicr am y ffordd orau o fynd ymlaen? Cysylltwch â’n staff labordy i ddod o hyd i lif gwaith a deilwrir i’ch nodau ymchwil WalesGenePark@cardiff.ac.uk

Paratoi llyfrgell NGS

Gall ein staff roi cymorth parhaus ar bob cam o’r biblinell genomeg, gan gynnwys echdynnu DNA, paratoadau llyfrgell DNA/RNA, llyfrgell ansawdd data (QC), dilyniannu Illumina a data dilyniannodi DNA y genhedlaeth nesaf (NGS). Dyma rai o’r llifoedd gwaith y mae ein staff yn eu gweithredu fel mater o drefn wrth baratoi llyfrgell NGS:

  • Illumina DNA PCR-Free Library Prep, Tagmentation (Illumina)
  • Illumina DNA Prep Guide (Illumina)
  • TruSeq Exome Library Prep (Illumina)
  • TruSeq Methyl Capture EPIC Library Prep (Illumina)
  • NEBNext Ultra II DNA Library Prep kit for Illumina (BioLabs)
  • Nextera DNA Sample Preparation (Illumina)
  • Nextera Rapid Capture Enrichment (Illumina)
  • MicrobExpress Kit (Life Technologies)
  • TruSeq Stranded Total RNA (Illumina)
  • NEBNext Single Cell/Low Input RNA Library Prep Kit for Illumina (BioLabs)
  • NEBNext Globin & rRNA Depletion Kit (BioLabs)
  • NEBNext Ultra II Directional RNA Library Prep Kit for Illumina (BioLabs)
  • TruSeq Stranded mRNA Sample Preparation (Illumina)
  • NEBNext Multiplex Small RNA Library Prep Set for Illumina (BioLabs)
  • TruSeq Small RNA Library Prep (Illumina)
  • TruSeq ChIP Sample Preparation (Illumina)

Llwyfannau dilyniant Illumina

  • MiSeq
  • NextSeq 550
  • NovaSeq 6000

Illumina NovaSeq 6000, NextSeq 550 and MiSeq.

Gwasanaethau eraill ar gael ar Parc Geneteg Cymru:

  • Covaris – Ultrasonicator (DNA/RNA darnio mecanyddol).
  • Meintioli DNA/RNA yn fanwl gywir ar gyfer dilniannodi DNA y genhedlaeth nesaf (NGS).
  • Nodweddu llyfregell, DNA/RNA HS a phecyn safonol (TapeStation, Agilent).
  • BioAnalyser (Library characterisation)